反渗透膜清洗剂只在清洗系统污染状况，包括系统结垢，微生物污染及有机物颗粒附着等，目的是为了提高反渗透膜脱盐率，降低一二段压差，从而延长膜的使用寿命。
反渗透膜清洗剂一般分为酸性清洗剂和碱性清洗剂。
反渗透膜酸性清洗剂
酸性清洗剂一般为一种低PH值的液体配方，也有固体存在，PH值基本2.5-3.5，主要用于去除碳酸钙和其它类结垢，适用于目前市场上绝大多数反渗透膜，中空纤维膜，纳滤及超滤膜。一般情况下，酸性清洗剂会与碱性清洗剂共同使用。
反渗透膜碱性清洗剂
碱性清洗剂是一种高PH值的液体配方，PH值一般在11左右，主要用于去除有机物、污泥以及其它附着于膜表面的颗粒，适用于目前市场上绝大多数反渗透膜，中空纤维膜，纳滤及超滤膜。一般情况下，碱性清洗剂会与酸性清洗剂共同使用。
膜分离系统运转期间，进水中的有机物会在膜表面聚积。有机物的出现为微生物的生长提供了环境，从而导致微生物污垢。这些污垢阻碍水流通过膜，从而导致产水量降低，操作压力增高，系统出现额外压差，从而使膜受到难以恢复的损坏。此外，膜表面下的污垢累积会使穿过膜的溶解性物质增加，从而导致产水水质变差。在产水水质变差或膜损坏发生之前，应通过现场清洗或离线清洗去除垢物。出现以下迹象时，需要进行清洗。渗透水量显著下降，系统压差显著增高，或盐渗透量增高，从而导致水质变差。
